ABSTRACT
A common basis to address the dynamics of directly transmitted infectious diseases, such as COVID-19, are compartmental (or SIR) models. SIR models typically assume homogenous population mixing, a simplification that is convenient but unrealistic. Here we validate an existing model of a scale-free fractal infection process using high-resolution data on COVID-19 spread in São Caetano, Brazil. We find that transmission can be described by a network in which each infectious individual has a small number of susceptible contacts, of the order of 2-5. This model parameter correlated tightly with physical distancing measured by mobile phone data, such that in periods of greater distancing the model recovered a lower average number of contacts, and vice versa. We show that the SIR model is a special case of our scale-free fractal process model in which the parameter that reflects population structure is set at unity, indicating homogeneous mixing. Our more general framework better explained the dynamics of COVID-19 in São Caetano, used fewer parameters than a standard SIR model and accounted for geographically localized clusters of disease. Our model requires further validation in other locations and with other directly transmitted infectious agents.
ABSTRACT
Objetivos: O objetivo do estudo foi determinar a incidencia de possiveis reinfeccoes por SARS-CoV-2 em doadores de sangue de um hemocentro publico referencia da Organizacao Pan-Americana de Saude, localizado no estado de Sao Paulo. Material e Metodos: O presente trabalho utilizou os dados de um estudo de coorte prospectivo, com a coleta de amostras de sangue e saliva de 152 doadores de sangue, no periodo de julho de 2021 a janeiro de 2022. Desse total, 107 sao casos que tiveram sorologia previa positiva para SARS-CoV-2 e 45 sao controles negativos. Os participantes foram acompanhados em quatro visitas ao hemocentro, a cada dois meses, para a coleta de amostras e relatos de sintomas e vacinacao. Posteriormente, foram realizados testes sorologicos e RT-PCR em tempo real para deteccao de SARS-CoV-2 em todas as amostras. Resultados: Dos 152 participantes, 13 (8,6%) apresentaram resultados de RT-PCR positivos para SARS-CoV-2, sendo observado 7 casos de possiveis reinfeccoes e 6 casos recem-infectados. Avaliando apenas os participantes positivos, 8 (61,5%) sao do genero feminino e 5 (38,5%) do genero masculino. 100% dos participantes positivos alegaram estarem vacinados com ao menos duas doses da vacina para COVID-19, 2 (15,4%) declararam sintomas de COVID-19 durante a coleta de amostras, enquanto 11 (84,6%) negaram a presenca de sintomas. Com relacao a faixa etaria dos participantes infectados, 2 possuiam de 19-28 anos, 4 de 29-38 anos, 3 de 39-48 anos, 3 de 49-58 anos e 1 doador de 62 anos. Discussao: Foi evidenciado a possivel reinfeccao por SARS-CoV-2 em 7 participantes, como tambem 6 novas infeccoes nos casos controle. Tal achado, associado com o fato de que todos os participantes positivos estavam vacinados no periodo em que as amostras foram coletadas, sugere a tendencia de que mesmo com a vacinacao ainda e possivel infectar-se pelo virus, alem de que a infeccao previa nao confere imunidade duradoura, o que foi constatado tambem em outros estudos. Todavia, e interessante destacar que a maioria dos participantes infectados foram assintomaticos (84,6%), o que propoe que a vacinacao promove a diminuicao da gravidade dos casos. Os nossos achados tambem demonstraram que nas faixas etarias de 29 a 59 anos houveram mais participantes infectados, sendo justamente as faixas etarias expostas a situacoes de risco, possivelmente devido a necessidade de locomocao e trabalho. Ademais, o numero apresentado de casos positivos pode ser em razao da diminuicao das restricoes de distanciamento social. Conclusao: As nossas analises, apesar de apontarem para o surgimento de novos casos de SARS-CoV-2 na populacao estudada, confirmaram o importante papel da vacinacao, visto que foi observado a diminuicao de individuos sintomaticos e casos graves. Por fim, em nossos resultados preliminares foram constatadas provaveis reinfeccoes pelo virus, nas quais serao necessarios testes adicionais para confirmacao desse achado. Copyright © 2022
ABSTRACT
Objetivos: A COVID-19 foi a doenca que causou o quadro de pandemia, ocasionando diversos casos e obitos ao longo do mundo. Uma estrategia para o tratamento de quadros graves da COVID-19 foi o uso de plasma convalescente, obtido de doadores convalescentes da doenca, com alta producao de anticorpos, de forma a permitir a neutralizacao do virus e melhora no quadro clinico. Embora muitos estudos destaquem o uso do plasma convalescente, poucos descrevem propostas para coletar plasma com concentracao de anticorpos anti-Spike aceitaveis para o uso em individuos acometidos com a forma grave da COVID-19. Dessa forma, o objetivo deste estudo foi avaliar os fatores sociodemograficos ligados a producao de anticorpos IgG anti-Spike em candidatos a doacao de plasma convalescente na cidade de Manaus-AM. Material e metodos: Foram incluidos no estudo 123 candidatos a doacao de plasma convalescente, do genero masculino, que tiveram o diagnostico da COVID-19 30 dias antes da doacao, sem historico de vacinacao previa. Foi realizada uma coleta de 4 mL do sangue periferico para obtencao do soro, utilizado para quantificacao de anticorpos IgG anti-Spike por quimioluminescencia, expressos em AU/mL, atraves do kit Architect SARS-CoV-2 IgG II Quant (Abbott). Os doadores foram segregados com base na concentracao de anticorpos em baixa producao (< 50 AU/mL), producao intermediaria (50-1,280 AU/mL) e alta producao (> 1,280 AU/mL), segundo informacoes do kit, e recomendacao internacional. Os dados sociodemograficos de idade, genero, cor de pele, indice de massa corporal (IMC), uso de ventilacao mecanica e dias internados foram utilizados para fins de comparacao entre os grupos. Foi realizado o teste de ANOVA, Qui-Quadrado e teste exato de Fisher para comparacao dos dados sociodemograficos, alem dos testes de correlacao de Spearman. Resultados: Nossos dados demonstraram uma maior prevalencia de doadores com alto indice de IMC na populacao de alto produtores de anticorpos (p = 0.0254). Alem disso, tambem observamos que a concentracao dos anticorpos IgG anti-Spike apresentou grau de correlacao positiva com a idade (r = 0.240;p = 0.008) e IMC (r = 0.247;p < 0.006). Discussao: Nossos resultados demonstram uma relacao entre a idade e o IMC na producao de anticorpos anti-Spike em doadores convalescentes com alta concentracao de anticorpos. Essa relacao pode estar atrelada a efeitos de imunomodulacao, bem como ao grau de lesao tecidual e sistemico apresentado pelos pacientes mais velhos e/ou com maior IMC. A relacao desses fatores com a producao de anticorpos ainda e uma area pouco explorada, o que salienta a necessidade de compreender os mecanismos imunologicos associados a producao de anticorpos, junto com a protecao dos pacientes convalescentes. Conclusao: Nosso estudo demonstrou que o IMC dos acometidos pela COVID-19 pode contribuir para a alta producao de anticorpos de classe IgG anti-Spike. No entanto, estudos adicionais sao necessarios para compreender os aspectos imunologicos associados a maior protecao da populacao, bem como producao de anticorpos com maior eficacia pelos individuos acometidos pela COVID-19. *AM e AGC contribuiram igualmente para este trabalho. Copyright © 2022